記者29日從四川農(nóng)業(yè)大學(xué)獲悉，四川農(nóng)業(yè)大學(xué)國家重點實驗室、水稻研究所李仕貴與欽鵬教授團隊聯(lián)合中科院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所梁承志研究員團隊分析揭示了水稻基因組中的“隱藏”變異。

這一研究成果以《基于33個水稻遺傳多樣性材料的泛基因組分析揭示“隱藏”的基因組變異》為題，于北京時間28日深夜由國際著名學(xué)術(shù)期刊《細(xì)胞》(Cell)在線發(fā)表。

四川農(nóng)業(yè)大學(xué)和中科院團隊選取了具有高度代表性的33個水稻材料，采用最新的第三代基因測序技術(shù)，對其中31份材料進行了長片段測序、高質(zhì)量基因組組裝及基因注釋。結(jié)合已報道的日本晴和蜀恢498兩個材料的參考基因組，經(jīng)過系統(tǒng)的比較分析，共鑒定到171072個基因結(jié)構(gòu)性變異和22549個基因拷貝數(shù)變異。

這些基因組變異無法利用傳統(tǒng)手段鑒定到，絕大多數(shù)在先前研究中均未被發(fā)現(xiàn)，但在重要農(nóng)藝性狀調(diào)控中發(fā)揮重要作用。如著名優(yōu)質(zhì)稻品種“越光”中一個早熟位點(qDTH7-3)，很可能就是由OsMADS18基因在“越光”產(chǎn)生兩個拷貝，導(dǎo)致基因表達量升高從而表現(xiàn)早熟表型。

此次研究過程中，中國科研人員還首次構(gòu)建了水稻圖形基因組，是水稻中迄今最為完整的基于圖形結(jié)構(gòu)的泛基因組。為了方便廣大研究人員使用相關(guān)數(shù)據(jù)，他們還搭建了網(wǎng)站，便于使用基因組序列和查詢遺傳變異等內(nèi)容，促進水稻功能基因組學(xué)和育種應(yīng)用研究。

李仕貴表示，此研究打開了結(jié)構(gòu)變異研究的大門，將有助于加速水稻功能基因組學(xué)和分子設(shè)計育種研究，為選育高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)、綠色安全水稻新品種提供基礎(chǔ)支撐。接下來團隊將把研究成果運用到應(yīng)用基礎(chǔ)研究和育種工作中，力爭培育出更多產(chǎn)量高、品質(zhì)好、抗性強的水稻品種。(完)

關(guān)鍵詞： 水稻基因 科研人員 研究 變異